[是人造生命,還是修改生命?] 人造生命
發(fā)布時間:2020-03-24 來源: 歷史回眸 點擊:
5月20日,美國科學(xué)家宣布世界首例“人造生命”――完全由人造基因控制的單細胞細菌誕生。 被冠以“人造生命之父”的克雷格•文特,只是認為其團隊成功改造了新種類的細胞而已。
15年來,克雷格•文特(J. Craig Venter)博士一直追逐著一個夢想:從零開始構(gòu)建出一個基因組,然后用它創(chuàng)造合成生命,F(xiàn)在,他和Craig Venter研究所(JCVI)的成員們終于讓夢想成為現(xiàn)實。文特博士的研究團隊在最新一期的《科學(xué)快訊》(《Science Express》)上發(fā)表了他們的研究論文,詳細介紹了怎么制造出一條細菌染色體,然后把這條染色體移植到一個細菌體內(nèi)以取代它原有的DNA(脫氧核糖核酸)。在這個合成基因組的驅(qū)動下,這個微生物細胞開始自我復(fù)制,并制造出一種全新的蛋白質(zhì)。
科學(xué)雜志《人造生命》(《Artificial Life》)主編以及里德學(xué)院的哲學(xué)教授馬克•貝道(Mark Bedau)說,“這是生物學(xué)和生物科技歷史上的決定性時刻。”約翰霍普金斯大學(xué)醫(yī)學(xué)院的酵母菌生物學(xué)家杰夫•博伊科(Jef Boeke)也認為它代表了合成基因組學(xué)這一新領(lǐng)域的重要技術(shù)里程碑。
文特博士的團隊創(chuàng)造的合成基因組和自然細菌體內(nèi)的基因組幾乎完全一致。而這個基因組也稱得上是造價不菲,前后耗資將近四千萬美元,花了20名研究人員超過十年的時間。盡管如此,制造能生產(chǎn)燃料或者藥品的更加復(fù)雜的基因組,并讓它像在單細胞中一樣自我繁殖仍然是個不可企及的計劃。要想從頭開始組合,配對和設(shè)計一個生物體的基因組,基因工程師要做的事情還多得很。
合成細菌的想法源于文特博士、JCVI成員克萊德•哈奇森(Clyde Hutchison III)和漢密爾頓•史密斯(Hamilton Smith)負責的一個項目:確定微生物所必須的最少基因?qū)?在此基礎(chǔ)上,增加能夠促使一個細菌轉(zhuǎn)變成可供人類利用的化合物的基因。1995年,這三人領(lǐng)導(dǎo)的一個研究小組對生殖支原體(Mycoplasma genitalium,一種細菌)染色體的60萬個堿基完成了基因排序。這是自由生存有機體中最小數(shù)量的基因組。這種微生物含有500種左右的基因,研究人員發(fā)現(xiàn),刪掉其中的100種基因并不會帶來任何不良影響。
要證明實驗暗示的最小基因組,就必須完成這兩個步驟:合成一整條的細菌染色體,然后將其植入一個受體細胞內(nèi)。但制造和控制整條染色體的技術(shù)當時還未出現(xiàn)。直到2007年,文特、史密斯和哈奇森才最終實現(xiàn)把自然染色體從一個微生物移植到另外一個微生物體內(nèi)。一年之后,他們又成功制造出一條人造染色體。這條染色體和生殖支原體染色體相稱,但同時又包含“水印”DNA序列,以便于兩者之間的區(qū)分。
不過,對這兩個步驟的組合卻陷入僵局。部分原因在于生殖支原體生長過于緩慢,一個單獨實驗就可能耗費上好幾個星期。研究小組中途決定更換微生物,對含有100萬個堿基但生長迅速的絲狀支原體(Mycoplasma mycoides)進行基因排序,并開始制造其染色體的合成復(fù)制品。到2009年,實驗顯示他們已經(jīng)能夠分離出絲狀支原體的染色體,將其放在酵母菌中,修改它的基因組,然后把它移植到山羊支原體(Mycoplasma capricolum)中。他們下一步要做的就是,證明這種細菌DNA的合成復(fù)制品也可以達到一樣的效果。
為了打造合成染色體,研究人員開始求購DNA。他們從Blue Heron公司購買了1000多個DNA序列,每個DNA序列含有1080個堿基。每個DNA序列的末端有80個堿基與下一個序列重疊,以方便它們按正確的順序組合在一起。組合好的DNA序列中有四個序列含有獨特的堿基串。這些堿基代碼可以拼出一個電子郵件地址,參與到這個項目中的人的名字,以及一些名言警句。
合成DNA是在酵母菌中逐步完成的,利用的是酵母菌的DNA修復(fù)能力。研究人員首先會把短小的基因片段連接成含10000個堿基的長鏈,然后以同樣方式連接成含100000個堿基的DNA序列,最后形成完整的基因組。但當他們最開始把合成基因組植入山羊支原體中后,什么也沒有發(fā)生。就像計算機程序員調(diào)試出錯軟件一樣,他們對合成DNA和自然DNA的組合進行系統(tǒng)化地移植,3 個月后才最終找到了出錯的一對堿基。
在經(jīng)過數(shù)個月移植試驗失敗之后,有一天研究人員在實驗室的一塊培養(yǎng)板上發(fā)現(xiàn)了一群快速生長的藍色細菌菌落。藍色表明細胞使用了新的基因組。收到消息的文特博士立刻帶著攝像機趕到實驗室,拍下了這塊培養(yǎng)板。
他們從這個菌落中提取了DNA進行排序,確認了這種細菌含有的是合成基因組,它制造的蛋白質(zhì)也具有絲狀支原體而非山羊支原體的特征。這個菌落的生長模式也跟絲狀支原體一樣。文特說,“我們很明顯地將一種細胞分子改造成了另一種類!蔽奶匕堰@個細胞稱之為“地球上第一個電腦制造的具備自我復(fù)制能力的物種。”
范德比爾特大學(xué)的分子生物學(xué)家安東尼•福斯特(Anthony Forster)承認這是個非常令人驚異的成就。但他強調(diào),這個項目并沒有創(chuàng)造一個真正的合成生命形式,因為基因組是被植入到一個現(xiàn)存的細胞分子中的。波士頓大學(xué)(Boston University)的生物工程師吉姆•柯林斯(Jim Collins)也認為,文特制造出的實際是一個含有合成的自然基因組(synthesized natural genome)的有機體。而這并不能代表一種新的生命形式。
在許多生物學(xué)家看來,文特的“合成細胞”只是個驗證項目,用于培育它的實驗室技術(shù)將會很快被應(yīng)用于其它更具商業(yè)潛力的細菌種類。事實上,多家公司已經(jīng)試圖在合成生物學(xué)這個新領(lǐng)域發(fā)掘商業(yè)產(chǎn)品。文特博士建立的Syntheric Genomics公司跟Exxon Mobil集團就簽訂了一份價值6億美元的合約,以幫助其制造一種可以將二氧化碳轉(zhuǎn)化成燃料的藻類。文特博士說他已經(jīng)著手為這項技術(shù)申請專利,盡管現(xiàn)在這種專利類別會面臨很大的法律挑戰(zhàn)。
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